Le génotype : quelles informations apporte un génotype?

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Quelles informations apporte un génotype ?

Dans un génotype on ne peut écrire TOUS les gènes. Par convention on n’écrit

• QUE les allèles qui diffèrent de la souche de référence si la souche mutée est considérée seule.
• SEULEMENT les formes qui diffèrent de l’autre souche à laquelle on la compare (dans un croisement par exemple).

La même souche peut donc, suivant le contexte, avoir un génotype noté de façon différente.

Exemple

• La souche A haploïde porte l’allèle a₁ sur le chromosome rouge, seule différence avec la souche de référence.
  Comparaison de la souche A à la souche de référence
  • on écrit le génotype de type A : a₁
• La souche B haploïde porte l’allèle b₁  sur le chromosome bleu, seule différence avec la souche de référence.
  Comparaison de la souche A à la souche B
  • on écrit le génotype de type A : a₁ b⁺

Le génotype est écrit selon la ploïdie de l’organisme, c’est à dire le nombre de lots de chromosomes différents caractéristiques de l’espèce à laquelle il appartient.

Le génotype est écrit sous forme de fractions à étages qui peuvent être multiples, chacun indiquant les allèles mutants dans un lot de chromosomes (ici un rouge, un bleu et un vert).
Si seul le gène a est noté (allèle a₁) : 

Dans tous les génotypes de ploïdie supérieure à 1, chaque étage de la fraction représente le génotype d’un des parents haploïdes.

L’association, dans le génotype, des formes alléliques telles qu’on les trouvaient chez les parents respectifs est ce que l’on appelle la phase.

Un même  diploïde pourra avoir son génotype écrit de différentes façons en fonction de ses origines.

Voir un exemple

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